Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms