Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASQ1P31415 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASQ1P31415 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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