Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA11P31270 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA11P31270 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms