Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND3P30281 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND3P30281 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND3P30281 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms