Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMOD1P29536 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMOD1P29536 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms