Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTGFP29279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTGFP29279 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTGFP29279 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTGFP29279 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTGFP29279 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTGFP29279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTGFP29279 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms