Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms