Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4AP27815 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4AP27815 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms