Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPH2P23942 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPH2P23942 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms