Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRZ1P23471 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRZ1P23471 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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