Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPAP23025 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPAP23025 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPAP23025 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPAP23025 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XPAP23025 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XPAP23025 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPAP23025 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPAP23025 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XPAP23025 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPAP23025 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms