Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms