Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms