Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACO1P21399 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ACO1P21399 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACO1P21399 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACO1P21399 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACO1P21399 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACO1P21399 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms