Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms