Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms