Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCLP19338 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCLP19338 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCLP19338 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCLP19338 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCLP19338 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCLP19338 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCLP19338 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCLP19338 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCLP19338 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCLP19338 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCLP19338 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms