Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDCP19113 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDCP19113 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDCP19113 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDCP19113 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDCP19113 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDCP19113 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDCP19113 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDCP19113 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDCP19113 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms