Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT15P19012 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT15P19012 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT15P19012 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT15P19012 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT15P19012 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms