Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGAM1P18669 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms