Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCP1P17987 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCP1P17987 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms