Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB4P17483 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB4P17483 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms