Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB3P16520 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB3P16520 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB3P16520 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms