Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCFC2P16383 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms