Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKBP12277 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKBP12277 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKBP12277 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKBP12277 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKBP12277 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKBP12277 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKBP12277 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKBP12277 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKBP12277 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKBP12277 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKBP12277 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms