Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYGBP11216 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PYGBP11216 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PYGBP11216 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PYGBP11216 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYGBP11216 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYGBP11216 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PYGBP11216 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYGBP11216 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.5 ms