Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2P10911 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCF2P10911 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCF2P10911 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCF2P10911 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCF2P10911 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCF2P10911 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms