Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM163BP0C2L3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM163BP0C2L3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms