Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRCP08575 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRCP08575 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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