Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRAP08240 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRAP08240 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms