Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPBP07199 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPBP07199 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPBP07199 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms