Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGAVP06756 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms