Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4AP04350 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms