Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
COL2A1P02458 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL2A1P02458 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL2A1P02458 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms