Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DQB1P01920 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DQB1P01920 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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