Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA2P01563 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFNA2P01563 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFNA2P01563 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms