Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1RP00736 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1RP00736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1RP00736 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1RP00736 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1RP00736 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1RP00736 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1RP00736 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1RP00736 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1RP00736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1RP00736 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1RP00736 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1RP00736 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms