Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms