Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN7O95471 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN7O95471 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms