Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIF4AO95239 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms