Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFASCO94856 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFASCO94856 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFASCO94856 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFASCO94856 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFASCO94856 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFASCO94856 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFASCO94856 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFASCO94856 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms