Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP9O75884 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms