Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF3JO75822 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3JO75822 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms