Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F6O75461 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F6O75461 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F6O75461 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F6O75461 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F6O75461 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F6O75461 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F6O75461 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F6O75461 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms