Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH4O75427 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRCH4O75427 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms