Protein–RNA interactions for Protein: O75376

NCOR1, Nuclear receptor corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR1O75376 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCOR1O75376 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCOR1O75376 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms