Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTN2O75298 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN2O75298 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN2O75298 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN2O75298 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RTN2O75298 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN2O75298 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN2O75298 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN2O75298 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN2O75298 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN2O75298 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN2O75298 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms