Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF40O75150 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF40O75150 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF40O75150 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF40O75150 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF40O75150 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms