Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNSO60931 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNSO60931 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNSO60931 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNSO60931 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNSO60931 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNSO60931 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNSO60931 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms