Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIN3BO60391 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIN3BO60391 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms